1.
灭菌程度不同：医用外科口罩多数是口罩中等级最高和防护能力最强的口罩，灭菌性的口罩会进一步进行灭菌，在口罩包装有效内完全无菌。
2.
防护作用不同：两者口罩防护作用不同，灭菌性医用口罩一般比非灭菌型医用口罩的防护效果要好一些，可以有效阻断污染源不被人体吸收。
普通口罩与医用灭菌型口罩的区别，就在于成品最后灭菌工序的有无，其它指标如过滤效率或者气流阻力等指标都是同样要求。
普通型口罩也是严格按，照医疗器械管理方法来管理的，是足够安全满足日常公众的防护需求，但不能用于需严格控制微生物环境的，医疗工作，如ICU、手术室等。
医用口罩的灭菌都是采用环氧乙烷灭菌，分为灭菌型及微生物限度指标≤200cfu/g，包装识别有灭菌，或无菌字样，并具备表面抗湿性、合成血阻断性能，即能够预防血液、体液喷溅的功能等，医用防护要求。
主要用于医务人员临床防护工作或有创操作时佩戴。
