对于大家最关心的结局问题,作者青山冈昌没有过多透露,只是表示会是出乎所有人预料的,同时动画会先于漫画结束,而最后的全部剧情将在漫画内得到彻底解答,至于在柯南完结之后是否会继续创作基德的故事,青山则表示：‘还没考虑太多,不过如果读者喜欢的话也没什么不可以’ 官方消息,关于哀的问题,青山老师给出了最后的答案,哀在最后的几集中,被组织以极隐秘的方式所枪杀,目前青山老师的这部分的漫画已经画完。
具青山老师说,在哀生命即将结束的时候,与柯南{工藤新一}的对话很经典,她就这样退出了这段本不属于她的感情。
而小兰被组织绑架了,柯南开始跟组织进行最后的对决。
至于结局,大家不要想的很乐观,青山老师说会出呼所有人的意料！！ 阿笠博士的真面目 黑衣人的真正的首脑,就是一直隐藏在他们身边的阿笠博士DOC。
LEE。
事情是这样的,工藤优作原先就 怀疑并且侦察黑衣组织。
以小说家的身份为掩护,秘密调查。
发现一些线索后特意搬到黑衣组织首脑阿笠家的隔壁住,并且从小培养新一 ,并派新一和阿笠混熟想借此侦察一些情报。
当阿笠开始怀疑工藤父子的时候,想出一条毒计,他派GIN和沃克跟踪出去约会的小兰和 新一,大家都看过第一集,其实交易是幌子,真正的目的是跟踪,于是新一也就被他们变成了柯南。
之后,阿笠顺理成章地成为了新一的 同伴与监护人,并且柯南实际上成了阿笠手中的人质,当时新一的父母第一次出现的那一集,实际是和阿笠谈判的,最终的结果是阿笠以 柯南要挟他们两个人流放到瑞士。
而优作因为不能和新一说明真相,从而让新一感到受骗,受到伤害。
只能同意阿笠的要求,不再回日本 ,所以你们看优作只有103集的时候回过日本,还是变装的,不能让阿笠发现。
其实APTX-4689就是阿笠和灰原哀的父母联合开发的,而成功后哀的父母意外身亡。
阿笠留着柯南不死只不过想观察药品还有没 有其他的副作用。
但是突然有一天,优作和有纪子突然潜回日本,和柯南（103-104集）秘密接触,让他感受到了威胁,于是安排 一个间谍时刻跟随在柯南的身边,那就是灰原哀。
哀其实是APTX-4689的第一个实验品,本来药的目的是永葆青春,没想到竟然 适得其反产生副作用,造成了身体变小。
而柯南事件发生后,哀就成了在柯南身边卧底的最好人选。
为什么柯南从来没有被骚扰过就是因 为柯南其实一直在黑衣组织最厉害的老大的监视下。
毛利小五郎也是因为追查阿笠才从警界退出的,当时枪击非英里事件只是借口,所以 后来暮木说毛利总是把他们引向歧途。
青山刚昌已经给大家提示了,不过因为太晦涩所以没几个人看得出来。
其实阿笠这两个字,如果拆解成阿竹立用日文反过来拼写就是拉丁 文里面的莫里亚帝。
所以阿笠博士其实应该叫莫里亚帝教授——福尔摩斯里的罪恶的教授。
