菏泽市市区指的是牡丹区，开发区和高新区。虽然定陶也是区，但是距离菏泽较远，严格来说，不算是菏泽市区。
牡丹区是菏泽市的中心城区，开发区和高新区也是从牡丹区分出去的。牡丹区是菏泽市的政治、经济、交通中心。牡丹区位于山东省西南部黄河下游南岸。辖区的西北部临黄河，与河南省隔黄河相望。它是中国最大的牡丹生产、出口基地和观赏游览区。
菏泽市市区下辖两个区：牡丹区、定陶区，7个县：曹县、成武县、单县、巨野县、郓城县、鄄城县、东明县。菏泽，古称曹州，位于山东省西南部。鲁苏豫皖四省交界地带，东与济宁市相临，东南与江苏省徐州市、安徽宿州市接壤，南与河南省商丘市相连，西与开封市、新乡市毗邻，北接河南濮阳市。
