肛门有疾病应该挂肛肠外科的,肛门科包括的疾病有痔疮、肛瘘、肛裂、肛旁脓肿、肛周脓肿、毛囊炎、藏毛窦、直肠息肉、脱肛、肛门瘙痒等疾病,如果有肛门周围的疾病都可以先挂肛肠科看看的,如果肛肠科认为不是本科的疾病,会给你介绍其他科室。