整个蝙蝠群的性周期是同步的，因此大部分交配活动发生于数周之内。孕期多不相同，在延迟着床的情况下同一种类的时间差别为3-10个月。
许多种类的雌体妊娠后迁到一个特别的哺育栖息地点。蝙蝠每年繁殖一次，每产1-2崽；幼仔初生时无毛或少毛，常在一段时间内不能视不能听；
幼崽生长很快，一般在6-8周龄时即可达到成体大小，1-2月龄即脱去胎毛。幼仔由亲体照顾5周-5个月，按不同种类决定。寿命最长可达33年，大多数种类可能平均4-5年。
蝙蝠通常一年只生一胎，一胎只产一仔，并不多，不产卵 。
蝙蝠的繁殖从6月末到7月上旬，全为雌性的群体开始产子。幼子在全是雌的群体中成长，大约在出生后 40~45天左右便已长到与双亲体型相同并且能够飞行
