南通的新老城区的划分还是比较明显的主要还是以濠河为界。
濠河是南通的环城河道，一向的说法是濠河以内都是老城区，以十字街为中心向外直到六桥，这里是古通州县城所在地。濠河就是通州县城的护城河，濠河以外的是则是后来经济发展了才慢慢扩建开的。
南通改革开放后的近二十年，由于城市发展的需要，南通又在老城区和经济技术开发区之间规划了规模更大的新城区
经国务院批准，对南通市行政区划作如下调整：
一、撤销南通市崇川区、港闸区，设立新的南通市崇川区，以原崇川区、港闸区的行政区域为新的崇川区行政区域，崇川区人民政府驻虹桥街道桃坞路44号。
二、撤销县级海门市，设立南通市海门区，以原海门市的行政区域为海门区行政区域，海门区人民政府驻海门街道北京中路600号。市政府网站显示，南通市区有崇川区、港闸区、通州区和富民港办事处（与南通经济技术开发区管委会合署办公），下辖如东县、启东市、海门市、如皋市、海安市。此番区划调整之后，南通市将下辖三区（崇川区、通州区、海门区）、三县级市（启东市、如皋市、海安市）、一县（如东县）。
