一般来说，关于木耳的种类主要有黑木耳、毛木耳、燕耳、皱木耳、白木耳等。
1、黑木耳
黑木耳，别名黑菜，桑耳，本菌，树鸡，木茸，因为外形似人体耳朵，加上颜色为黑褐色而得名；黑木耳为木耳科植物，其性平味甘，入胃、大肠经，具有滋补、润燥、养血益胃、活血止血、润肺润肠的功效。
2、毛木耳
毛木耳，又叫做黄背木耳，营养成分和黑木耳的相似，具有清肺益气、止痛活血的功效，其中所含的粗纤维含量比较高，这些纤维素对于人体内的食物消化，吸收，代谢都有很好的促进作用；在毛木耳的耳背茸毛中含有丰富的多糖类抗癌物质。
3、房耳
房耳，别名房县黑木耳，产自于湖北省房县；房县位于湖北省西北部，介于大巴山和武当山之间，是我国著名的黑木耳生成基地，中外驰名的“木耳之乡”。房耳以色鲜、肉厚、朵大、质优、营养丰富，又因其“形似燕，状如飞”，被称为“燕耳”，有“山珍之王”的美称。2009年5月，国家质检总局批准对房县黑木耳实施地理标志产品保护。
4、皱木耳
皱木耳，子实体一般比较小，富含胶质，耳形或圆盘形，无柄，着生于腐木上，直径多在1-7厘米×1-4厘米。子实层生里面，淡红褐色，有白色粉末，有明显皱褶并形成网格，外面稍皱，红褐色。孢子透明无色，光滑，圆筒形，弯曲，10-13微米×5-6微米，担子棒状，三横隔。
5、白木耳
白木耳，别名银耳，雪耳，银耳子等，属于真菌类银耳科银耳属，是门担子菌门真菌银耳的子实体，有“菌中之冠”的美称；银耳子实体纯白至乳白色，直径大概在5-10厘米左右，柔软洁白，半透明，富有弹性。
6、秋木耳
秋木耳，是一起生物，有点像木耳，但是这种木耳是黑色的，有点暗绿色，研究出这种类似木耳的植物营养价值比木耳要高，当时是秋天发现的，所以叫做秋木耳。秋木耳一般都比较小，但耳片比较舒展。
东北野生木耳最好吃，主要品种有野生黑木耳、春耳、伏耳、秋耳。
东北野生木耳，生长在林间倒木，伐树桩上面，这种野生木耳的产量是非常少的，目前市场上的总量还不到0.1%；野生黑木耳耳片较小，中等厚度，一面是灰色的，一面是黑色的，耳根小，较轻，口感好，非常的脆嫩，营养价值也是非常之高的。
所谓的代料栽培的黑木耳，也就是用剧末子装到塑料袋子中种植出来的黑木耳，它又分为春耳、伏耳、秋耳；春耳是在早春5-6月份末出的黑木耳，耳片朵大，厚，耳根大，正面为黑色，背面为灰色，口感较好；伏耳是在6月低-8月初之间所出的木耳，耳片大，耳片薄，双面菌为黑色，光滑，口感差，质量差；8月10日-10月20 日之间出来的木耳为秋耳，秋耳耳片多为单片，耳片小，耳片厚度中等，耳根小，正面灰黑色，背面灰色，有短绒毛，口感好，质量好，所以说不是耳片越大，越厚，质量越好。
