吴茱萸扦插时间一般在3月中旬，选一至二年生的健壮枝条。枝条选取时，一定要选择母株上部，并且要靠近东南、南或南西面的枝条。此类枝条光照充足，聚集的养分相对较多，酶活性高，利于扦插生根成活。
剪取枝条最好在清晨或傍晚，无雨后的阴天也可以，下雨或雨后2 d内不要进行采取。
首先在母株上剪取20 cm左右的小段，且每段上有芽2～3个。其次将枝条小段上端剪平，下端修剪成斜面，插条两端约离芽各1.5 cm。最后放入干净的保鲜袋中，并在保鲜袋中放2个湿棉球，再封住袋口。运输途中要遮住阳光，防止袋中温度过高损坏插条。
吴茱萸扦插的最佳时间是在春季的三月份四月份，随着气温的升高，大地万物复苏，是种植的最佳时间。
