自制酸奶需要用到乳酸菌，但乳酸菌包括很多类别，凡是能分解乳糖产生乳酸的细菌都通称为“乳酸菌”。在这些乳酸菌当中，能用于制作酸奶的主要有两种，这就是“嗜热链球菌”（英文代号为S）和“保加利亚乳杆菌”（英文代号为L）。 嗜热链球菌是链球菌属的一种，而保加利亚乳杆菌是乳杆菌属的一种。这两种乳酸菌存在“共生作用”，它们相互帮忙，能够促进产酸速度，让酸奶能正常凝固，而且能产生比较好的风味。用这两种菌混合培养制成发酵剂，然后加到牛奶当中，在40-42℃的温度下培养几个小时，就可以把液态的牛奶做成凝固的酸奶了。 但是，仅仅依靠这两种菌做出的酸奶并不能称为优质酸奶，因为嗜热链球菌和保加利亚乳杆菌虽然是制作酸奶必不可少的，但保健作用并不是很强，而且它们本身不能在大肠中定植，而是“一过性”的保健菌。也就是说，这些菌只在通过胃肠道当时发挥点作用，却不能起到“调整肠道菌群”的作用。 因此，要做出风味比较好，而且保健效果也较好的酸奶，我们还要添加一些益生菌进去。 所谓益生菌，是通过改善宿主肠道菌群平衡、对宿主发挥有益作用的活的微生物的总称。乳制品中常常加入的益生菌主要是嗜酸乳杆菌（代号为A）和双歧杆菌（代号为B，其中包括多个品种），还有一些乳酪乳杆菌的菌株等。这些菌种的保健作用比较强（如改善消化吸收、调节肠道菌群等），且有可能在体内定植。 那么，为什么所有酸奶中都要加S和L这两个菌种，而不是用A和B这些益生菌来发酵做酸奶呢？这是因为，单独用这些益生菌发酵的乳制品口感不理想。而且它们的生存条件苛刻，很难保证发酵成功。比如说，双歧杆菌（B）是厌氧菌，它们非常娇气，只要一见氧气就会死亡，而一般的发酵方法很难完全避免氧气。因此，为了保证酸奶的味道和口感令人满意，通常都会将益生菌与S和L这两个“常规”菌种混合搭配使用。目前，最常见的益生菌酸奶是在S和L之外再添加A菌和B菌中的某些菌株。 值得一提的是，并不是只有含益生菌的酸奶才值得喝，传统酸奶虽不含活性乳酸菌，但其营养价值也不能被忽视。这是因为，在乳酸菌发酵过程中，牛奶的营养成分并没有减少，而且这个过程分解了乳糖，维生素含量有所增加，钙的利用效率上升，还产生了帮助分解乳糖和蛋白质的酶类等。所以，即便没有特殊的益生菌，喝酸奶也是有益处的。 家庭自制酸奶的菌种一定要有保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌这两种菌，否则酸奶就很难做成，或者风味很难令人接受。有这两种菌就足以做成酸奶。如果想增加其他保健菌，也一定要按照说明上建议的比例，和这两种菌混合使用才可以，但不必太过执着于保健菌的种类多少，更不能全用保健菌种来做酸奶。 如果不买菌种也没关系，只要找到市场上自己比较喜欢的益生菌酸奶，舀一勺混在牛奶里，就可以做菌种了。为保证制作成功，用成品酸奶做菌种的合理比例是1份酸奶加入10～20份的牛奶当中。但是，做成的自制酸奶最多只能再做一次菌种，传代的次数多了，酸奶凝固会越来越慢，风味也会变差，还可能因为污染杂菌而影响安全性。
