重点排污单位确定标准依据企业排污量大小而定。
如果企业废水排放量一天超过100吨就会被列入水重点排污单位，如果企业有组织废气排放管道直径超过1米会被列入大气重点排污单位，如果企业危险废物年产生和转运处置量超过100吨会被列入土壤重点排污单位，列入重点排污单位的一般要求安装在线监测系统。
（一）一种或几种废水主要污染物年排放量大于设区的市级环 境保护主管部门设定的筛选排放量限值。 废水主要污染物指标是指化学需氧量、氨氮、总磷、总氮以及 汞、镉、砷、铬、铅等重金属。筛选排放量限值根据环境质量状况 确定，排污总量占比不得低于行政区域工业排污总量的 65%。
（二）有事实排污且属于废水污染重点监管行业的所有大中型 企业。 废水污染重点监管行业包括：制浆造纸，焦化，氮肥制造，磷 肥制造，有色金属冶炼，石油化工，化学原料和化学制品制造，化 学纤维制造，有漂白、染色、印花、洗水、后整理等工艺的纺织印 染，农副食品加工，原料药制造，皮革鞣制加工，毛皮鞣制加工， 羽毛（绒）加工，农药，电镀，磷矿采选，有色金属矿采选，乳制 品制造，调味品和发酵制品制造，酒和饮料制造，有表面涂装工序 的汽车制造，有表面涂装工序的半导体液晶面板制造等。 各地可根据本地实际情况增加相关废水污染重点监管行业。
（三）实行排污许可重点管理的已发放排污许可证的产生废水 污染物的单位。
（四）设有污水排放口的规模化畜禽养殖场、养殖小区。
（五）所有规模的工业废水集中处理厂、日处理 10 万吨及以上 或接纳工业废水日处理 2 万吨以上的城镇生活污水处理厂。各地可 根据本地实际情况降低城镇污水集中处理设施的规模限值。
（六）产生含有汞、镉、砷、铬、铅、氰化物、黄磷等可溶性 剧毒废渣的企业。
（七）设区的市级以上地方人民政府水污染防治目标责任书中 承担污染治理任务的企业事业单位。
（八）三年内发生较大及以上突发水环境污染事件或者因水环 境污染问题造成重大社会影响的企业事业单位。
（九）三年内超过水污染物排放标准和重点水污染物排放总量控 制指标被环境保护主管部门予以“黄牌”警示的企业，以及整治后仍不能达到要求且情节严重被环境保护主管部门予以“红牌”处罚的企业。
