最优的是真正的野生灵芝，栽培灵芝以段木栽培好一点，太空包栽培差得多，最差的就是快速发酵的菌丝粉（质量最差的栽培灵芝产品，早在80年代就有人大量生产，后来被淘汰）。
人工栽培的灵芝，问题一般有几个：
①“种性漂移”问题，这是任何专家都没有办法的问题。也就是原有品种特性在人工栽培或者饲养条件下，原有品种特性不可避免的严重退化问题。比如在我们国家大熊猫那么珍贵，为什么还要让大多数大熊猫在野外生长？就是这个原因，人工养殖的大熊猫将来还是大熊猫吗？灵芝人工栽培，品种特性一代不如一代，糟糕的是我国人工栽培灵芝的品种绝大多数还是80年代从韩国日本等国引进的品种，如：韩国大片、日本赤芝、美国灵芝等等品种，不信你自己上网查，看他们栽培的是不是这一些品种。一般到第三代，就几乎丧失原来的品种特性了。总有人不相信，你只要在百度里搜一搜“种性漂移”就知道啥意思。
生长条件不同，品质就相差十万八千里。比如把西瓜嫁接到普通南瓜苗上长出来外观是西瓜，但不能吃，如果嫁接到瓠子南瓜上，却味道极优，这就是生长条件不同引起的。还不信，你把最普通的红苕（甘薯）种到黄泥地里和山坡沙壤地里，看将来长出来的红苕是不是一个味道！
栽培灵芝和野生灵芝的生长条件当然是不同的，你认为野生灵芝和栽培灵芝会一样吗？因此内行认为栽培灵芝有其形而无其实。
②大规模栽培灵芝时，必然大量使用杀虫剂、杀菌剂。这是任何一个栽培者都不可避免的。天下有哪一个栽培者敢说自己不用杀虫剂、杀菌剂？不用杀虫剂、杀菌剂，你能大规模种植出来吗？特别是近几年兴起的灵芝仿野生栽培方法，其实质就是将菌袋或者发好菌的段木埋在室外土里，长出来外观会和野生灵芝比较接近，因此常假冒野生灵芝销售，殊不知：这种栽培法，其菌袋极易遭受最难杀灭的地下害虫如白蚁等的严重危害，甚至绝收，因此必然会使用高毒、长残留期的杀虫剂预先处理土壤。
③有个别不良栽培者在培养基中加入硒、锗等弥补栽培灵芝中这两种最重要的元素的不足。但你不知道的是：他们加入的工业级的硒、锗，其中必然含有汞、铅、砷等对人严重有害的杂质。
灵芝能高效富集环境中锗、硒等等有益元素，同时也能富集环境中的汞、铅、砷等有害元素，也就是说即使环境中有极少量的汞、铅、砷等，在灵芝的子实体、孢子粉中可能就要高出百倍千倍。可笑的是还有人炒作他们的“富硒灵芝……”的。
④有不少的正规的科研论文，明确测定出有多种有效成分的含量野生灵芝远高于栽培灵芝。虽然在网上有不少的人宣传栽培灵芝更优，但绝对没任何一篇正规的科研论文支持，你支持哪一边？充其量人在一些论文中看到支持以下观点的：单就某种成分而言，栽培灵芝似乎可替代野生灵芝的。
