在《小麦进城》的剧情中，林木和黄鹂最终没有在一起。在剧情的后期，林木向小麦表达了自己的感情，但小麦已经决定留在城里继续学业，不愿意放弃自己的未来。林木最终选择了尊重小麦的选择，并祝福她能够实现自己的梦想。在剧情的结尾，林木和黄鹂虽然有一些暧昧的情节，但并没有明确表明两人是否在一起。
根据我所了解的情况，小麦进城后，林木和黄鹂并没有在一起。尽管他们之间有过一段美好的时光，但由于各自的生活轨迹和目标的不同，最终他们选择了各自的道路。
林木继续在城市中追求自己的事业，而黄鹂则回到了乡村，继续她对大自然的热爱。尽管他们分开了，但他们的回忆和感情将永远留在彼此的心中，成为他们人生中宝贵的一部分。
