不是副科级三级主任科员可以晋级二级主任科员（副科级能直接晋升二级主任科员吗）

不可以。公务员职级晋升只能一级一级升。四级主任科员任职满2年后可晋升为三级主任科员，再任职满2年后可晋升为二级主任科员。提拔任用就有可能。四级主任科员是副科，提拔为正科，正科对应就是二级主任科员。所以，努力工作，争取提拔任命。