两位五通电磁阀和三位五通电磁阀的区别主要在于其结构和功能上的不同：
1. 结构上：两位五通电磁阀只有两个连接口，分别用于控制进气和放气；而三位五通电磁阀有三个连接口，分别用于控制进气、排气和中间位置。
2. 功能上：两位五通电磁阀只有两个状态，即开和关；而三位五通电磁阀有三个状态，即中间位置、开和关。三位五通电磁阀可用于控制单动和双动气缸，可以实现正转、反转和停机等多种控制模式。
在实际应用中，两位五通电磁阀通常用于普通控制回路，如控制流体进出、传递电信号等；而三位五通电磁阀通常用于需要多种控制模式的控制回路，如液压控制、气动控制等。所以在选型时需要根据实际应用需求选择合适的电磁阀类型。
