日本没有毁灭紫禁城有以下原因：
一是当时的紫禁城已经是空城，很多文物都转移了，日本觉得没什么价值了；二是故意装出爱惜故宫开来制造假象，毕竟他们扶植了伪满洲国，故宫是清朝皇家宫殿，也有可能顾忌傀儡皇帝溥仪的感受；三是给自己制造国际“形象”，不愿意毁坏故宫来引起全世界声讨；总之，日本当年没有毁掉故宫绝对不是什么“善心”，他们的行为完全是按照侵略者的图谋来决定的。
日本在侵华期间曾经派出过许多文物专家进入中国，他们进行文物研究和博物馆收集工作。在当时，由于日本政府鼓励侵华文物抢夺，许多文物从中国被掠走，并被侵华日军从北京运往日本。但是对于紫禁城这样的重要文物地点，实际情况较为复杂，导致其没有被破坏。
一方面，紫禁城经过多年的修缮，基本上保存了明朝至清朝间的建筑风格，成为世界上保存最完整的宫廷建筑群之一，因此侵略者对其保护起来。另一方面，日本侵华时期将其作为政治、军事和文化中心，曾在紫禁城内设立了高级指挥部和监禁和审判中国抗日知名人士的特务处，因此并没有将其破坏。
总的来说，日本并没有破坏紫禁城，主要是由于中华民族的保护和留存意识，以及紫禁城的历史和文化价值在当时的重要性。
