1、概念不同：异地加工是将加工进口材料委托另一直属海关关区内加工生产企业开展的加工。外发加工是经营企业因受自身生产特点和条件限制，经海关批准并办理有关手续，委托承揽企业对加工贸易货物进行加工。深加工结转是加工贸易企业将保税进口料件加工的产品转至另一加工贸易企业进一步加工后复出口的经营活动。
2、手续不同：深加工结转办理出口报关手续，如以外汇结算的，海关可以签发收汇报关单证明联。外发加工是要经海关批准并办理有关手续，委托承揽企业对加工贸易货物进行加工。
3、范围不同：外发加工还允许经经营企业所在地主管海关批准，外发加工的成品、剩余料件以及生产过程中产生的边角料、残次品、副产品等加工贸易货物，可以不运回原企业。异地加工和深加工结转则不需要。
