番石榴果腐病主要为害果实。果实受害,于果实表皮生褐色、不规则形病斑,凹陷(泰国大果番石榴);或淡褐色,中央暗灰色,病斑凹陷(本地种)。
其后,于病斑上长出小黑点,随病斑扩大和增多,终至全果腐烂,果肉呈灰色。