嘉黎县属藏北高原与藏东高山峡谷结合地带的高原山区,平均海拔4500米,县城所在地海拔4488.6米。
地势从西北到东南由高到低倾斜。主要山脉有阿依拉山、鲁贡拉山、杰拉山、岗巴拉山、楚拉山、崩希拉山等,都是念青唐古拉山的支脉。