牡丹在定植后，第一年不作任何修剪，在根茎外部就会长出许多新芽，我们称作土芽;到第二年春天的时候，等到新芽长到10cm左右时，便可以选几个长得茁壮、分布均匀的保留下来，作为主要的枝干，我们称为定股，剩下的就可以全部剪掉。为了使株丛逐年扩大和丰满，每年或次年可以留1-2个新芽作为枝干培养。
牡丹整形修剪一般是在入冬前进行，首先去掉茎上部无腋芽的草质茎部分并将叶柄全部摘除，露出枝干，剪除过密枝、弱枝、病枝或受损伤枝条，以及内膛的重叠枝和徒长枝、萌枝和萌芽。
拿芽工作可在春季3月下旬至4月上旬进行，拿芽过后，应随时巡视，除掉无用的不定芽。另外，每年入冬前还要把残留的花梗枯梢剪掉，只保留当年生枝条有芽眼而完全木质化的部分。
