不是一回事，是两所学校，没有关系。
1、燕京大学
燕京大学是20世纪初由四所美国及英国基督教教会联合在北京开办的大学，也是近代中国规模最大、质量最好、环境最优美的大学之一，创办于1919年，创始人司徒雷登长期担任校长、校务长。
1942年至1945年，因太平洋战争爆发而被侵华日军封闭的燕京大学曾内迁成都办学，抗战胜利后回到北平复校。在中国高等学校1952年院系调整中，燕京大学被撤消。
2、北京大学
北京大学创立于1898年维新变法之际，初名京师大学堂，是中国近现代第一所国立综合性大学，创办之初也是国家最高教育行政机关。1912年改为国立北京大学。
1937年南迁至长沙，与国立清华大学和私立南开大学组成国立长沙临时大学，1938年迁至昆明，更名为国立西南联合大学。
1946年复原返回北平。1952年经全国高校院系调整，成为以文理基础学科为主的综合性大学。2000年与原北京医科大学合并，组建为新的北京大学。
