最好的消毒方法是物理消毒法：
（1）日光照晒。日光照晒消毒是一种最经济方便的方法。它是把被消毒的物品放在日光下暴晒，利用阳光中的紫外线作用，使病原微生物灭活。此法较适用于鸽舍的垫草、用具等的消毒。日光照晒时要让被消毒物品充分暴露于阳光下，垫草在晒的时候应勤翻动，一般须晒2小时以上。
（2）机械清扫。这是消毒工作中的一个环节，不能单独作为一种消毒方法用，必须结合其他消毒方法一起使用。因为机械消毒是用通风、打扫、清洗等办法将鸽舍内空气、用具及地面污物清理出鸽舍，并不杀灭病原体。
（3）蒸汽消毒。蒸汽消毒是通过高热水蒸气的高温使病原体丧失活性。此法是一种应用较广、效果较好的消毒方法。因为高温蒸汽穿透力强，物品受热快。此法常用于医疗器械等小型物品的消毒。须注意消毒时间不能太短。
（4）煮沸消毒。这是利用沸水的高温作用杀灭病原体的一种消毒方法。它简单易行，且经济有效，常用于玻璃器皿，如试管、平皿、注射器、金属器械、工作服等物品的消毒。煮沸消毒时，若在水中加入0．5％~1％的肥皂或碱，可使物品上的污物溶解，同时可提高沸点，增强消毒效果。应用本法消毒时，要掌握消毒时间，一般从水沸腾时算起，煮沸20分钟左右。对于寄生虫性的病原体，时间应加长。
（5）焚烧。这是最为彻底的消毒方法。对于发生过严重传染病的鸽舍内的垫草、病鸽尸体、死胚蛋及蛋壳等应采用此法消毒。酒精火焰喷灯消毒也是一种焚烧消毒法，常用于鸽笼、料盘等金属工具的消毒。
