1、来源不同。蝲蛄是我国的本土原生物种，曾经在东北的长白山一带有较为广泛的分布；小龙虾据说是日本侵华时期引进的用来处理尸体的外来物种，繁殖能力强、对水质的要求也相对低。但是在我国吃货的强大消费能力下，也只能依靠人工养殖的方式来满足吃货的口舌之欲。
2、物种不同。蝲蛄，准确的说叫做“大头鳌虾”，是蝲蛄科、蝲蛄属的物种；小龙虾，也叫克氏原螯虾，是螯虾科、螯虾属的物种。两者属于不同科、不同属的不同物种。
3、对环境的需求。蝲蛄对水质的要求较高，大概在上世纪90年代之前，东北的河流、小溪中还有很多的蝲蛄。但是在90年代的中后期，随着工业的发展、环境和水质的污染，蝲蛄就逐渐的在大部分水域中消失了。现在只有在长白山附近的一些天然、无污染的水域才会有蝲蛄的分布；而对于小龙虾来说，对水质的要求并不高。脏水也可以存活，活力之强与鲶鱼有一拼。
4、味道不同。蝲蛄的味道是鲜、香，只需用清水煮、蒸不需要添加任何的调味料就是一道美味。小时候最喜欢和农村的小朋友下河沟里抓蝲蛄回家煮着吃，非常的鲜；但是小龙虾就不同了，由于饲养的水质问题，自身带有一定的土腥味，烹饪的时候需要重盐、重辣、重油来遮盖其土腥味。如果有机会的话建议您尝试一下东北名菜“蝲蛄豆腐”。
5、外观不同。蝲蛄也叫大头鳌虾，头大、身子小、肉少，肉最多的地方可能就是那两个大螯了。活体颜色一般呈褐色，烹饪之后呈鲜红色；小龙虾则不一样，头相对小，提醒相对要大那么一点。而且，颜色呈黑褐色或者青色，烹饪之后也是呈红色的状态。
