低聚半乳糖好，低聚半乳糖都能够被人体肠内8大有益菌所利用，能够抑制人体肠内有害菌的生长繁殖，低聚半乳糖具有较强的耐酸性、耐热性，不会因为在加工过程中的高温杀菌及人体胃酸所分解而失去其本来应有之特性，而低聚果糖则不具备这些特性。
低聚半乳糖能有效地被双歧杆B菌和乳酸杆A菌同时利用。低聚果糖FOS等低聚糖则只可被乳酸杆A菌利用,对双歧杆B菌则不明显。
低聚半乳糖和多聚果糖各有各的好处。多聚果糖与低聚半乳糖的区别，首先从本质上就有所不同，多聚果糖一般是从菊苣根中提取出来的，经过提取过滤等加工除去蛋白质，矿物质等，最后制作成具有保健作用的低聚糖，低聚半乳糖一般不需要加工，是一种天然的功能性低聚糖，多在母乳中比较多。
