海龟是用肺来进行呼吸的，但它胸部不能活动，是一种吞气式的呼吸方式，每隔一段时间便要将头伸出海面来呼吸。但也可以比较长时间地在水下生活，因为它们都还有一种具特异呼吸功能的器官——肛囊，即直肠两侧的一对薄囊，在肛羹袋的壁上密布著许多微血管。当绿海龟在海中栖息时，能有节奏地收缩着肛门周围的肌肉，使海水在肛门、直肠和肛囊间进出，此时微细血管内的红细胞即可从海水中摄取氧气，不必把头伸出水面进行呼吸了。 所谓的两栖动物，是指幼体和成体会出现较大形态上的变形，即“变态”。比如青蛙，呼吸系统就由蝌蚪的腮变成青蛙的肺。而海龟一生是不会发生上述变化的，所以不是两栖动物，而是爬行动物。
爬行动物本身也具有很多特点，主要是呼吸系统和循环系统上的。所以不能单就其能在水陆两地活动就认为它是两栖。
