在贮藏中一定要注意保持种子的纯度和净度，严格控制温度，如种子含水量达到安全水分的要求，种子成熟度又好，是能够长期忍受最低温度对其侵袭的，这样的种子可以长期贮藏在干燥的冷库里，而不影响其发芽能力。
如果玉米种子含水量在14%以上，就要采取有效的管理措施，这样的种子要保存于温度在0℃以上的环境里，一直到来年播种，温度都不得低于0℃。
1、短期种子冷库用于保存生产性种子库内温度控制15℃～20℃种子冷库，相对湿度50%～60%。种子容器从有纸袋、塑料袋、布袋、玻璃瓶等。种子含水量12%以下。种子预期寿命2～5年。
2、中期保存种子冷库用于保存流动性种子，种子库温度控制在0℃～10℃范围，相对湿度不大于60％。种子容器与长期库的相同。种子含水量6%～9%。种子预期寿命10～30年。
3、长期种子冷库，用于长期保存种子，库内温度控制在在-10℃～-20℃范围，相对湿度不大于60%。国际上对正常种子长期保存推荐的参考标准为-18℃或更低的温度条件，种子含水量5±1%（以湿重为基础）。封入不透气的容器内，如密封的金属盒、铝箔袋、塑料复合薄膜袋、玻璃瓶等。种子预期寿命30～50年，或者更长时间。
