1、低温管理不当
在蘑菇培育期时，如果在低温季节培养环境的湿度较大，或者喷水量大，导致蘑菇上附着的水分较大，吸收大量的水分后，在低温环境不能及时蒸发掉，会导致蘑菇的新陈代谢减弱，引起大量的和微生物侵入，感染病害，导致蘑菇发黄。
防治措施：了解每个品种的温型和正常生长温度，做好管理，另外在喷水不宜过多，要控制培养室的湿度，保持蘑菇子实体正常生长为宜，另外要喷洒各类的剂，杀死或抑制病菌的生长。
2、持续低温
气候持续低温气候会使的培养室的温度过低，温度过低，蘑菇的子实体处于一个生长不良的状况，从而引发多种疾病，出现黄菇现象。
防治措施：在低温时要想办法将培养室的温度升上来，一般白天要维持在15度以上，发现因低温已发的疾病后，要及时喷洒药剂，在加强管理，防止黄菇现象扩散。
3、营养不良
蘑菇生长周期较短，约一月可收茬一次，待连续收茬3-4次后，菌袋中的营养已不能满足蘑菇出菇的正常生长了，在现蕾后，由于子实体得不到充足的养分，导致其不能正常的生长，逐渐因营养不良出现发黄，直至死亡。
防治措施：在发现菌袋中养分已不能满足蘑菇的生长时，可在菌袋中加入适量的营养液，确保这一茬的顺利生长，待生长成熟，及时将其收割，再将没有任何养分的菌袋淘汰，重新开始另外一批的蘑菇培养。
