阿坝州13个县的分别是：马尔康市、九寨沟县、小金县、阿坝县、若尔盖县、红原县、壤塘县、汶川县、理县、茂县、松潘县、金川县、黑水县。
1、汶川县
汶川县隶属于四川省阿坝藏族自治州，位于青藏高原东部边缘、四川省西北部，居川西北高原和阿坝藏族羌族自治州东南部，东西宽84公里，南北长105公里，总面积4084平方公里，县城海拔1236米。
南距省会成都146公里，北离州府马尔康202公里，区位优势明显，交通便利。辖威州、绵虒、映秀、漩口、水磨、卧龙、三江、耿达8镇，龙溪、克枯、雁门、银杏4乡。
2、理县
理县位于青藏高原东缘，阿坝藏族羌族自治州东南部，地处北纬30°54′-31°12′，东经102°32′-103°30′。东北与茂县、黑水接壤，西南与小金相连，东南与汶川相通，西北与马尔康、红原毗邻，距省会成都202公里，距州府马尔康193公里，县城海拔1888米。
3、茂县
茂县是四川省阿坝藏族羌族自治州下辖县，位于四川省西北部、阿坝藏族羌族自治州东南部的青藏高原东南边缘，地理坐标为东经102°56′～104°10′，北纬31°25′～32°16′，地跨岷江和涪江上游高山河谷地带，东西长116.62千米，南北宽93.73千米，幅员面积3903.28平方公里。
4、松潘县
松潘县，四川省阿坝藏族羌族自治州辖县。位于青藏高原东缘，阿坝藏族羌族自治州东北部，行政区域面积8486平方公里，人口74945人（2015年），辖2个镇、23个乡，县人民政府驻进安镇。
5、九寨沟县
九寨沟县，隶属于四川省阿坝藏族羌族自治州，位于青藏高原东部边缘，阿坝州东北部。东、北与甘肃省文县、舟曲县、迭部县交界，西、南与四川省若尔盖县、平武县、松潘县接壤。
6、金川县
金川县原名靖化县，位于川西北高原，阿坝藏族羌族自治州西南部，地处青藏高原东部边缘，大渡河上游，隶属四川省阿坝州。金川县因境内河流大金川（大渡河上游）得名，而大金川因沿河诸山有金矿得名。
7、小金县
小金县为四川省阿坝藏族羌族自治州下辖县。藏名赞拉，凶神之意。因境内小金川得名。 小金县地处青藏高原东部边缘，位于四川省西北部，在阿坝藏族羌族自治州南部。东邻汶川县，西毗甘孜州丹巴县，南连雅安市宝兴县，北接马尔康县。
8、黑水县
黑水，地处青藏高原东部，阿坝藏族羌族自治州中部，北与松潘相接，东西与红原、茂县相邻，南和西南与理县、马尔康相连，距离省会成都284公里，县城海拔2350米。黑水藏名为“措曲”，是“生铁之水”之意。黑水河属岷江上游支流。有小黑水河、毛尔盖河及溪沟99条。
9、马尔康市（原马尔康县）
马尔康市（原马尔康县），是四川省阿坝藏族羌族自治州管辖的县级市，亦是该州首府，藏语意为“火苗旺盛的地方”，引申为“兴旺发达之地”。马尔康是以原嘉绒18土司中卓克基、松岗、党坝、梭磨四个土司属地为雏形建立起来的，亦称“四土地区”。
