1.科属不同
柠檬，芸香目，芸香科，柑橘属的植物，柠檬又称柠果、洋柠檬、益母果等。
青柠，也称来檬、绿檬，中国称青柠、酸柑，是无患子目，芸香科，柑橘属其中数种植物的统称。
2.形态特征不同
柠檬，小乔木，枝少刺或近于无刺，嫩叶及花芽暗紫红色，叶片厚纸质，卵形或椭圆形。单花腋生或少花簇生。果椭圆形或卵形，果皮厚，通常粗糙，柠檬黄色，果汁酸至甚酸，种子小，卵形，端尖；种皮平滑，子叶乳白色，通常单或兼有多胚。花期4-5月，果期9-11月。
青柠，其果实的特征是淡黄绿色的球形、椭球形或倒卵形，直径约4至5厘米。
1. 二者颜色不同
青柠无论是生长过程，还是成熟过程，其颜色都是青色的。而柠檬的颜色会随着生长过程由青变黄的。
2. 二者味道不同
青柠闻起来由一种淡淡的柠檬香气，而柠檬闻起来是一种浓郁的清香味道。
3. 二者外表不同
青柠的外皮是比较光滑的，而柠檬的外皮纹理就比较粗糙了，摸起来手感不是很好。
4. 二者果肉不同
青柠的果肉颜色透亮，而柠檬的果肉颜色是淡黄色的。在果肉酸甜程度上，青柠吃起来比柠檬蒜。
