1、淤泥的沉积使河道变浅，使河道水体减少，影响通行。
2、增加耗氧量，易造成河道水质缺氧，引起鱼浮头。因为淤泥中含有大量的有机物质，有机物质进行氧化分解需消耗大量的氧气，造成底部缺氧，继而造成缺氧，引起池鱼浮头,引起死鱼事故的发生。
3、产生有害物质。由于底部缺氧，有机物质进行厌氧分解就会产生大量的有害物质，如氨、硫化氢、亚硝酸盐、甲烷气体等。
4、病害频发。由于水底淤泥中存在大量的寄生虫和致病生物，条件适宜时大量孽生繁殖。
河道清淤势在必行但要需把握尺度，不然容易二次破坏生态环境。
河道底部淤泥对水质影响较大。
河道底部淤泥，主要来自大气沉降、废水排放、雨水淋溶及冲刷、河岸侵蚀或矿化作用而积累在水体底部，对人类或生态环境健康有害的土壤、沙石、有机物等。
河道底部淤泥，隐藏在底泥中的氮、磷、有机质、重金属等污染物在环境条件适宜时，会大量释放进入上覆水体，在浓度梯度作用下，不断向上层整个水体扩散，可使水体色度、嗅味增加、透明度和pH值下降。
