由于人类活动和气候变化等原因，许多雨林动物面临着灭绝的风险，以下是一些已经灭绝的雨林动物：
假珊瑚蛇：绝迹接近半个世纪，2019年6月20日，保护国际基金会表示，探险家在洪都拉斯东部一个雨林内名为“失落的猴神之城”的古代遗迹中发现了它。
白面蝙蝠：曾被认定为灭绝物种，2019年6月20日，保护国际基金会表示，探险家在洪都拉斯东部一个雨林内名为“失落的猴神之城”的古代遗迹中发现了它。
绿森蚺：一种生活在亚洲和非洲的大型蟒蛇，由于过度捕杀和森林开发等原因，其数量正在急剧减少。
此外，还有一些雨林动物也面临着灭绝的风险，如亚洲象、大猩猩、亚马逊河豚、三趾树懒、巨嘴鸟、麝雉、美洲豹、美洲狮、美洲豹猫等。
狭面矛吻蝠、假树珊瑚蛇和虎甲虫,金刚鹦鹉这些物种只在尼加拉瓜有记录,均被认为已经灭绝。
