一、学校性质不同
大学里的本校一般称为公办学校或者一、二本学校；而分校则称为民办学校或者三本院校。本校一般由教育部和省市部门共同建设的大学，而分校一般是由公办学校结合社会力量办学，以“民办公助”的形式做一个分校，且分校大多是与本校在教学管理方面相独立的办学机构。
二、招生生源不同
一般本校的学生生源较好，录取分数较高，且招生范围广阔，面向全国省份招收；而分校一般是在本校学生招收完毕后，录取学生，分数较低，档次也较低。
三、毕业证含金量不同
对于本校的毕业生，学士学位证书，都是由本校名称命名，如中国矿业大学，代表是优秀的一本学生，是“211”、“985”重点大学出来的学生，含金量较高，就业平台好；而分校毕业生，如中国矿业大学徐海学院，是三本学校，档次大大降低。在找工作时会受一定程度的限制，没有本校毕业证含金量高。
四、学费费用不同
正常本校的学费较低，四五千左右；而分校的学费较高，一般一万五到两万元。若是有些中外合办的分校，价格更高。
首先我表示，我不是这两所学校滴，说的不对的大仙不要砍我。
山东科技大泰安分校与青岛科技大高密校区，没记错的话当然后者好些，山东科大是二本（不过有些专业收一本分数线）青岛科大是一本。
分校与本校的区别，这要看学校的设置，不能一概而论。例如，我们学校，本校区是一本，留学生，硕士，博士，博士后。分校的是三本，毕业证当然有区别。而山东科技大泰安分校（泰安校区是山科大三大校区之一，与本校区别不大，只是分校有些时候资源可能不如主校区那么丰富，泰安校区毕业证和学位证都盖山东科技大学的章）， 青岛科技大高密校区也是青岛科大的分校区，与青岛科技大学盖的章是一样的。
管他啥子分校不分校的，听我的，首先选好专业，哪个学校自己喜欢的专业好就去哪个学校，毕竟这两所学校都是山东省省属的，都不是教育部直属的，在当地来说区别不会那么明显。
