除藻的方法有多种，可以使用除藻剂、经常换水、避免阳光直射、使用生物控制等方法。另外，也可以在鱼池内按一个5瓦的灭菌灯，大约两天的时间，绿藻数量就会减少。此外，还可以使用草木灰法、猪粪消除法、施枫树叶汁法、马尾松叶法、硫酸铜消除法、蓝矾消除法等方法。需要注意的是，使用除藻剂时要选择无毒药剂，并且按照正确的方法进行操作。
1、人工清除。如果鱼塘里的绿藻不多，可以采取人工的方式清除，一般用尼龙网将绿藻从塘中打捞出来就可以了。不过绿藻繁殖速度很快，如果绿藻的规模比较大的话，人工清除就不管用了。
2、药物清除。鱼池长绿藻的原因是水体太肥，池中的氮磷钾元素太高，这种情况下可以药物进行治疗。通常用硫酸铜泡水或者用生石灰、漂白粉后兑水，每个月全池泼洒一次，这样不仅可以消灭绿藻，还能消毒杀菌。
3、定期清洗。大部分对付直立绿藻的办法只能管一时，通过定期清洗，可以大大延缓爆藻的时间。一般春秋季每两个月可以洗刷一次鱼池，在绿藻的繁殖季节，需要每月洗一次，预防爆藻。
