1、外形不同：
豚鼠的体形在啮齿类动物中偏大，身材短小但是强壮有力，头较大。耳朵短小贴着头部，毛发粗糙而且很容易脱落，没有尾巴。仓鼠身体短粗，通常为体长的一半，无鳞，上覆有浓密的毛发。尾毛的颜色差别很大，通常是灰色，灰棕色或沙棕色。 原始的仓鼠头发颜色更鲜艳，后背带红棕色和黑色腹部。
2、栖息环境不同
豚鼠生活在多岩石的斜坡，草原，森林边缘和沼泽上，可在夜间活跃。豚鼠可以承受从白天的22°C到晚上的-7°C的广泛温度范围。仓鼠广泛生活在草原，农田，沙漠，河谷，农田，花园和果园的山麓和灌木丛中，偶尔进入房屋。 仓鼠可以发现在海拔3600米以内的地方。
3、生活习性不同
豚鼠以植物性食物为食，对食物没有特殊要求。主要吃植物的绿色部分，杂草为主要食物，如青椒，生菜，樱桃番茄等新鲜的水果和蔬菜。仓鼠主要以植物种子为食，也吃植物的茎，叶，果实，偶尔也吃昆虫。冬季通过吃储藏食物来生活。
4、寿命不同
豚鼠的平均寿命相对长一些，有的豚鼠寿命可能达到10年左右。而仓鼠的寿命相对来说就要短很多，一般在2-3年左右。
