历史沿革可以概括为以下几个阶段：
学校前身：1958年，通辽师范专科学校、哲里木盟农业合作化学校、哲里木盟卫生学校分别创建。1978年，通辽师范专科学校升格为通辽师范学院，哲里木盟农牧农机学校升格为哲里木畜牧学院，哲里木盟医学院在哲里木盟卫生学校的基础上建立。1980年，通辽师范学院更名为内蒙古民族师范学院，内蒙古民族医学院在哲里木医学院的基础上建立，内蒙古蒙医学院在内蒙古民族医学院的基础上改建。
合并升格：2000年6月，由原内蒙古民族师范学院、内蒙古蒙医学院、哲里木畜牧学院三所本科院校合并组建成内蒙古民族大学。2006年，学校被确立为自治区重点大学，被批准为自治区政府奖学金蒙古国留学生培养院校。2009年，国家民委与内蒙古自治区签署协议共建，学校成为内蒙古第二所中央与地方共建院校。2013年9月，学校被批准为中国政府奖学金来华留学培养院校，入选国家“中西部高校基础能力建设工程”。2015年5月，学校入选首批国家“卓越医生（中医）教育培养计划试点高校”，蒙医学专业“五年制本科人才培养模式改革”获得批准。2018年3月，学校入选教育部首批“新工科”研究与实践项目。
内蒙古民族大学始建于1958年,2000年由原内蒙古民族师范学院、内蒙古蒙医学院、哲里木畜牧学院合并组建而成,是内蒙古自治区重点建设高校,内蒙古自治区人民政府和国家民族事务委员会共建高校,也是国家“十三五”中西部高校基础能力建设工程(二期)支持高校。经过62年的建设与发展,学校现已发展成为一所学科门类齐全、师资力量较为雄厚、教学设施相对完善、办学形式多样、教学质量优良、办学特色鲜明的综合性民族大学,累计培养各类人才18万余名,为国家和民族地区经济社会发展和稳定做出了重要贡献。
