1、鱼头形状：野生黄花鱼的鱼头小且尖，养殖黄花鱼的鱼头大且圆。
2、鱼尾的长度：野生黄花鱼的鱼尾长且有力，而养殖黄花鱼的鱼尾较为短小。
3、背鳍鱼鳞：野生黄花鱼的背鳍上有锯齿，鱼鳞带有光泽，养殖黄花鱼的背鳍光滑，鱼鳞为灰白色。
1、体型区别：人工养殖的黄花鱼和野生黄花鱼的体型就是不同的。野生黄花鱼的体型比较小，但人工养殖的黄花鱼体型相对来说比较大，有时候体型的差异很大，很明显可以区分出来。
2、颜色区别：人工养殖和野生黄花鱼的颜色也是不同的。野生黄花鱼的颜色是透色的或者是微黄色的，人工养殖黄花鱼的颜色则是灰白色的。
3、身体形状区别：二者身体的形状也有一定的差异。野生黄花鱼形状是比较薄，比较扁平；人工养殖黄花鱼的形状则是比较厚，比较肥的。
4、内脏区别：野生黄花鱼和人工养殖黄花鱼的内脏也是不同的，若是可以剖开它们的身体则可以明显看到。野生黄花鱼的内脏比较干净，但人工养殖的黄花鱼内脏有一些污浊的物质。
5、肉质区别：二者肉质也有比较明显的差异。野生黄花鱼由于活动比较多，肉质就比较紧实；但人工养殖的黄花鱼活动量不大，所以它们的肉质就会松散一些。
