慈姑育苗有三种方法：一是以整个球茎作种；二是切除球茎，留球茎在顶芽上；三是用刀直接在芽的基部将顶芽挖下，作为种子育苗，整个球茎食用，留种的数量以整个球茎作种计算，一般每亩50～55公斤。其中华南地区的白肉慈姑、沙姑、马蹄姑等均以球茎育苗，即利用球茎顶芽萌发成幼苗，并不断抽生匍匐茎，匍匐茎顶芽再发育成分株苗。当其长到3~4叶时拔出移栽，分枝苗成长后又生分枝苗，这样利用匍匐茎生长的特性，分批移苗，大量繁殖。苏州地区则切1/3球茎加顶芽育苗，即球茎贮藏到春播前折芽育苗。无论哪种方法育苗，都要选用顶芽完好、具备本品种形态特征、成熟、均匀一致的球茎。
一、催芽早水慈姑一般4月上旬将球茎顶芽切下丢入水塘催芽或用窝席围好，上盖湿草，并随时浇湿，保持15℃以上气温，约10~15天出芽即可插芽育苗，每亩大田需用顶芽10~12千克（种姑80千克左右）。晚水慈姑于5月上旬将堆藏的球茎取出，也可不经催芽而直接育苗。慈姑球茎在催芽前应清洗干净，在太阳下晒1～2天，至顶芽尖端略有萎缩，然后再进行催芽。催芽期间，每天可将草包放在水里浸泡一下，以保证每只种茎都有充足的水份供给，搬动时注意不要将芽碰断。
二、育秧选背风向阳的肥沃水田，于3月底至4月初施足河泥和厩肥约7500千克/亩，带水耕耙2~3次，随即耙平，等水澄清后做秧田。秧田宽1.3~1.6米，秧田间留走道40厘米左右。4月下旬插芽育苗，行株距8~10厘米见方，秧田面积多的行株距可放到13厘米见方。栽插深度一般要求顶芽第三节位入土1.5~2厘米，苗床上要保持3厘米深的浅水，以利生根（如土壤疏松可将顶芽入土2/3，以防放水后顶芽浮起）。三、管理慈姑在插秧后为了促进顶芽生根和秧苗生长，应浅水管理以提高土温，如遇寒流则适当灌深水保苗，过后再改浅水。
