科学修剪要遵循3大原则，分别是“剪阴不剪阳，剪上不剪下，剪密不剪疏，剪弱不剪强”、“通风透光病虫少，立体结果产量高”和“上开天窗下拉桩，内膛见梢又见光”。
也就是说树体上部的枝梢要剪，这样才利于阳光穿透树体，增大枝梢的受光面积。过密的枝条要剪去，太弱的枝条也要剪去，留下中庸枝。病虫喜欢潮湿阴凉的地方，把树体剪通透了，就不利于病虫繁衍了，从而减少病虫害的发生。
果树整体枝叶分布错落有致，阳光可以透过下层枝干、枝叶，内部通风透光，利于打药，对果子的生长也有利。
1、柑橘幼树修剪原则
在柑橘幼树期的时候其生长能力比较强，因此我们的修剪目的主要以抽发枝梢、培育健壮母枝、增大树冠等。在这个时期一轻剪为主，首先要剪除果树上病虫害、徒长枝条，然后合理疏除适量的密枝，防止营养消耗过度，降低果树长势，引发病虫害。然后在夏秋季的时候做好摘心工作，然后当徒长的夏秋梢长到9片叶子的时候进行摘心工作，促进分枝生长。再适当抹芽，疏花合理留果。
2、柑橘初结果树修剪原则
柑橘的初结果期主要在一次结果前一年到盛果期的时候，这个时候的树冠还在不断生长，长势也比较强。对枝条修剪是比较敏感的，因此为了尽早使树冠成型，修剪的时候还是要以培养树形为目的。要着重培育结果母枝，保证第二年的开花结果率，然后随着果树的树龄增加，逐渐提高修剪量。及时抹除夏梢、促进果树坐果，然后短截延长枝，适当摘心，冬季的时候短截结果枝条，促进第二年春季春梢的萌发，再合理压缩修剪枝组。
3、柑橘盛果树修剪原则
在盛果期的时候，柑橘树的生长已经逐渐平衡，果树内外基本上都可以结果了，每年的挂果量也会逐渐增加。不过经过五到六年左右后长势会逐渐变弱，夏秋梢的萌发受阻，主要以春梢为主。结果枝组的结果能力也会大量下降，如没有做好修剪工作的话，非常容易出现大小年的现象。所以在盛果期的时候要及时更新结果枝组，培育新的健壮结果母枝，调整好花果枝的比例，延长盛果时间。做好抹芽摘心、疏剪回缩等措施，随着柑橘树生长年限不断提高修剪量，做好大小年的预防工作。
