1，技术指标要求不同：医用口罩需要符合国家相应的技术指标要求，如对非油性小颗粒的阻隔效果、对细菌的过滤效率等。民用口罩则无严格的技术指标要求。
2，适用范围不同，医用口罩比如医用防护口罩适用于，医疗机构一线的医护人员，和工作人员防止呼吸道传染病使用，医用外科口罩适用于临床医务人员在有创操作等过程中所佩戴，在医院中一般用于常规防护。民用口罩主要是大众用于防尘、防霾、防飞沫、防异味、保暖等。
细分的话，区别大致如下：
一、作用及分类不同
民用口罩是用于过滤进入口鼻的空气，以达到阻挡有害的气体、气味、飞沫进出佩戴者口鼻的用具。主要分为棉布口罩、无纺布口罩、高分子材料口罩、活性炭粉滤芯口罩、活性炭纤维毡垫口罩。医用口罩能阻止大部分细菌、病毒等病原体，WHO推荐医务人员采用防颗粒物的防护口罩，以防止医院空气中的病毒感染。主要分为医用防护口罩，医用外科口罩，普通医用口罩。
二、使用人群不同
民用口罩大部分人群都适合佩戴，但是心脏或呼吸系统有困难的人（如哮喘肺气肿）、怀孕、佩戴后头晕、呼吸困难和皮肤敏感的人应该慎重选择。医用口罩根据分类不同使用人群也不同。
1、医用防护口罩适用于诊疗活动中接触经空气传播或近距离经飞沫传播的呼吸道感染疾病患者时佩戴。
2、医用外科口罩主要在洁净度十万级以内的洁净环境内，手术室工作，护理免疫功能低下患者及进行体腔穿刺等操作时佩戴。
3、普通医用口罩可用于普通医疗环境下工作的人员，防护等级最低。适用于一般卫生护理活动，如卫生清洁、配液、清扫床单元等，或者致病性微生物以外的颗粒如花粉等的阻隔或防护。
区别主要在于其用途不同。
一、普通口罩：是一般的民用口罩，主要有棉布口罩、无纺布口罩、高分子材料口罩、活性炭口罩等，不能防止病毒，主要用于过滤进入口鼻的空气以阻挡有害的气体、气味、飞沫进入佩戴者的口鼻。
二、医用口罩：包括普通的医用口罩、医用外科口罩、医用防护口罩。
普通的医用口罩：防护等级最低，对于预防新型冠状病毒感染无效，属于护理性的口罩。
医用外科口罩：对于普通民众来说，预防新型冠状病毒效果比较好，可以阻挡空气当中大于5μm的颗粒，对于呼吸道的飞沫基本上可以达到防护的作用，所以不密切接触新型冠状病毒的患者，佩戴医用外科口罩足以满足预防的需要。
医用防护口罩：防护的等级最高，属于N95口罩，对于空气中小于3μm的颗粒可以达到阻挡的效果，所以对于预防新型冠状病毒效果最好，一般适用于医务人员佩戴。
