区别主要在于政府配套措施的不同，包括社保、子女教育等等。远城区的也是武汉城市户口，只要是武汉城市户口待遇都一样。武汉市中心城区是指含江岸区、江汉区、桥口区、汉阳区、武昌区、青山区、洪山区等七个中心城区；武汉经济技术开发区、东湖新技术开发区、东湖生态旅游风景区和东西湖常青花园的适用中心城区政策；远城区是指东西湖区、汉南区、蔡甸区、江夏区、黄陂区、新洲区。
不过最好还是尽可能办理中心区的户口，看他登记的是否是你要的，因为中心区的城市户口待遇确实比别的有优势，比如医保什么的。
针对你的问题答复如下：主城区户口和远城区户口统称为城镇非农业户口，这两个没有什么本质的区别，从户口性质上来说，属于同一类型，是相对于农业户口而言的。
