植物与动物相比没有的结构层次是

动物体的结构层次由小到大依次是细胞→组织→器官→系统→动物体，植物体的结构层次由小到大依次是细胞→组织→器官→植物体．因此，高等植物的结构与高等动物相比较，不具有的结构层次是系统．因此选项D符合题意．

故选：D．