1、乳酸菌发酵剂：如乳酸菌、酸性乳杆菌等，能够促进有益菌的繁殖，抑制有害菌的生长，同时还能够产生有益酸性代谢产物。
2、硝化菌发酵剂：如亚硝酸盐还原菌、氨氧化菌等，能够促进有机氮物质的分解，加速氮素转化为植物易吸收的形态，提高肥料利用率。
3、磷酸菌发酵剂：如磷酸解脲杆菌、芽孢杆菌等，能够分解有机磷化合物，将难以被植物吸收的磷素转化为植物可吸收的无机磷。
4、固氮菌发酵剂：如蓝藻、根瘤菌等，能够将空气中的氮气转化为植物可吸收的氨氮，提供植物所需的氮素营养。
目前市场上的发酵菌剂非常丰富，但并没有绝对的“最好”之说
发酵菌剂的质量取决于多个因素，包括酶活力、发酵速度、适应性等等
针对不同的发酵需求和原料特性，选择适合自己的发酵菌剂是最重要的，而最好的发酵菌剂是能够在保证发酵效果的同时符合生产需求的
