1.所属性质不同
微店是一家提供商家服务的腾讯注资的第三方电商平台，致力于帮助商家基于社交关系开店，拓展和维护客户关系，提升经营效率，全面赋能商家做好社交电商生意。微店有手机端和pc端两种版本，为商家提供展示商品、在线交易、店铺营销的功能。微店现有商家数8000万，每月服务数千万消费者，不管是没有经验的网店小白还是有丰富经验的老店店主，微店针对不同的商家都提供了不同的解决方案，助力商家拥有自己的生意经。
微信小商店是基于微信公众平台打造的原生电商模式，是由微信直接开发运营的。它是小程序团队提供的一项新能力。无需开发、免费开店，帮助商家快速生成卖货小程序，让中小微商家、个体创业者可以零成本、快速拥有一个小程序店铺，在微信内实现电商业务的自主经营。但是它是没有流量扶持的，需要店铺自己对外引流推广。
2.发展规模不同
3.流量来源不同
