1、通过第一性征区分。公马与母马的第一性征有显著差异，普通人观察二者外观就可以辨别。
2、通过牙齿数量区分。一般情况下，公马的牙齿数量是40颗，母马的牙齿数量是36颗，公马要比母马多4颗犬齿。
3、通过体型外貌区分。由于第二性征的影响，公马和母马在体型外貌上有一定的区别。一般情况下，公马的体格较大、强壮，被毛浓密、长毛发达，头部显得重而大，颈部肌肉丰满，骨骼粗壮，胸深而宽，中躯较短。母马的体格较小，被毛细软、长毛较少，头较轻，颈较细，骨骼偏细致，胸不太宽，胸围率稍大，中躯较长，尻较宽。
4、通过神经反应去区分。通常公马容易兴奋，母马性情安静。
综上所述，公马和母马的区分至少有4种方法，前两种方法比较容易，普通人也能准确辨别马的性别。后两种方法需要有一定的经验和观察力才可以
