1. 数学科学学院：该学院是南京大学最早成立的学院之一，以数学基础研究为主，涵盖了数学、物理学、计算机科学等学科领域。
2. 物理学院：物理学院成立于1959年，是国内物理学科重要的教育、科研基地之一。该学院下设多个系别，包括理论物理系、精密光谱系、光电信息物理系等。
3. 化学化工学院：该学院是南京大学的综合性学院，拥有多个系别，包括有机化学系、无机化学系、高分子化学系、生物化学系等。
4. 计算机科学与技术学院：该学院下设多个系别，包括计算机科学系、软件工程系、计算机应用技术系等，是国内著名的计算机科学教育和科研基地之一。
5. 人文学院：该学院涵括了文史哲学科领域，下设多个专业，包括文学、历史、哲学、新闻与传播等。
