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柴窝堡湿地公园内主要水体为柴窝堡湖,柴窝堡湖位于新疆乌鲁木齐市区东南约45公里的博格达峰脚下的柴窝堡盆地,地处达坂城地区西部,是一个天然冷水性湖泊,由湖北面的博格达峰融雪及湖南面的公格尔峰融雪汇集而成。