在现代飞机上，厕所的粪便处理主要有两种方式，一种是使用污水处理系统进行处理，另一种则是采用真空吸排系统。
1. 污水处理系统：飞机上的厕所里装有污水箱和废水储存设备。航班结束后，地勤人员会将储存的废水从飞机上抽出，并进行处理。处理过程中，先通过过滤、沉淀等方式去除废水中的固体物质，然后再通过搅拌、氧化等方法，将污染物转化为无害物质，最后再通过消毒杀菌等步骤，确保处理后的污水符合当地排放标准，可以安全地排放。
2. 真空吸排系统：该系统通过真空泵将原本处于压力较低的厕所空间内的废物和尿液、纸巾等杂质污物，吸入飞机的管道中。吸走的废物经过密闭的管道输送到飞机机舱底部的收集和储存罐中，航班结束后，地勤人员将它们清理并运往处理场所进行处理或直接丢弃
