三羧酸循环叫做丙酮酸脱氢酶复合体。
反应过程共分4步，第一步前半部分不可逆。
1.脱羧，生成羟乙基TPP，由E1（丙酮酸脱氢酶组分）催化。 羟乙基被氧化成乙酰基，转移给硫辛酰胺。由E2（二氢硫辛酰转乙酰基酶）催化。
2.形成乙酰辅酶A。由E2催化。
3.还原型E2被氧化形成氧化型E2，由E3（二氢硫辛酰胺脱氢酶）催化，NAD+为氧化剂。
4.氧化硫辛酸，FAD变成FADH2。氢原子转移给NAD+变成NADH & H+。 丙酮酸脱氢复合体有60条肽链组成，直径30nm，E1和E2各24个，E3有12个。其中硫辛酰胺构成转动长臂，在电荷的推动下携带中间产物移动。
