仓鼠算是比较爱干净的动物，甚至略微还带有些洁癖。仓鼠容不得身上沾染一些异味，每当它的脸上粘上了脏东西，它都会用粉红色的小爪子不停地洗脸，直到脸上的脏东西掉落下来。仓鼠一般会先清理自己的头部以及面部的毛发，然后才是身体周围的毛发。当仓鼠把自己的毛发全部清理好之后，仓鼠毛发不但会变得蓬松，而且光泽也会凸显出。
仓鼠的尿味是比较浓烈的，有时会掩盖掉自身的气味，因此，仓鼠自己也不会愿意生活在尿味冲天的环境中。大多数仓鼠都能定点尿尿，而且一般仓鼠尿尿的地点，总是离自己窝最远的地方。建议在仓鼠排泄后，可以对仓鼠笼进行大扫除的时候，并在厕所内留下一些带有仓鼠新鲜尿液的垫材。将仓鼠笼里的垫材全部换掉，就是不能留有仓鼠原来的气味，换上全新的垫材。
