《斗破苍穹》特别篇《三年之约》的大结局如下：
在大结局中，萧炎和云韵终于在三年之约的期限内完成了各自的修行，并在最终的战斗中击败了各自的对手。两人在战斗结束后相遇，云韵向萧炎表白，并告诉他自己已经怀上了他的孩子。萧炎非常感动，表示自己愿意为云韵和孩子负责，并决定和云韵一起离开迦南学院。
与此同时，药老和小医仙也在寻找萧炎和云韵，最终他们在一片草原上找到了两人。药老告诉萧炎，他已经成功炼制出了一种能够让他恢复失去的灵魂力量的药物，并将其交给了萧炎。
最后，萧炎和云韵带着他们的孩子，以及药老和小医仙一起离开了迦南学院，开始了新的生活。整个故事以萧炎和云韵在草原上的幸福生活作为结尾，为整部剧集留下了一个温馨而感人的结局。
