1、财政拨款不同:差额事业编制由财政进行差额拨款;全额事业编制的全额由财政拨款。
2、单位性质不同:差额事业编制多数是医院和部分景点;全额事业编多为一些公益性事业单位和部分具有行政执法职能的事业单位。事业单位编制人员适用劳动合同法。